Karya | : | - Putri Cina , Penerbit Gramedia Pustaka Utama (2007)
- Segelas Beras untuk Berdua, Penerbit Buku Kompas (2006)
- Dari Pulau Buru ke Venesia, Penerbit Buku Kompas (2006)
- Petruk Jadi Guru, Penerbit Buku Kompas
- Kambing Hitam:Teori Rene Girard,Penerbit Gramedia Pustaka Utama (2006)
- Burung-burung di Bundaran HI,Penerbit Buku Kompas
- Ekonomi Kerbau Bingung, Penerbit Buku Kompas
- Bola di Balik Bulan, Penerbit Buku Kompas (2002)
- Bola-bola Nasib, Penerbit Buku Kompas
- Air Mata Bola, Penerbit Buku Kompas
- Ilmu Ngglethek Prabu Minohek (2004)
- Mengasih Maria: 100 tahun Sendangsono (2004) - editor
- Air Kata-kata (2003)
- Jembatan Air Mata: Tragedi Manusia Pengungsi Timor Timur (2003)
- Long and Winding Road, East Timor (2001)
- Pendidikan: Kegelisahan Sepanjang Zaman: Pilihan Artikel Basis (2001) - editor
- Membuka Masa Depan Anak-anak kita: Mencari Kurikulum Pendidikan Abad XXI (2000)
- Menggagas Paradigma Baru Pendidikan: Demokratisasi, Otonomi, Civil Society, Globalisasi (2000) - editor
- Sumur Kitiran Kencana: Karumpaka ing Sekar Macapat Dening D.F. Sumantri Hadiwiyata (2000)
- Sakitnya Melahirkan Demokrasi (2000)
- Bisikan Daun-daun Sabda (2000)
- Tak Enteni Keplokmu: Tanpa Bunga dan Telegram Duka (2000)
- Bayang-bayang Ratu Adil (1999)
- Menjadi Generasi Pasca-Indonesia: Kegelisahan Y.B. Mangunwijaya (1999) - editor
- Pergulatan Intelektual dalam Era Kegelisahan: Mengenang Y.B. Mangunwijaya (1999) - editor
- Cikar Bobrok (1998)
- Mata Air Bulan (1998)
- Sayur Lodeh Kehidupan: Teman dalam Kelemahan (1998) - editor
- Sisi Sepasang Sayap: Wajah-wajah Bruder Jesuit (1998)
- Semar Mencari Raga (1996)
- Aburing Kupu-kupu Kuning (1995)
- Nderek Sang Dewi ing Ereng-erenging Redi Merapi (1995)
- Hoffen auf den Ratu-Adil: das eschatologische Motiv des "Gerechten Königs" im Bauernprotest auf Java während des 19. und zu Beginn des 20. Jahrhunderts (1992) - Disertasi
- Baba Bisa Menjadi Indonesier: Bung Hatta, Liem Koen Hian, dan Sindhunatha, Menyorot Masalah Cina di Indonesia (1988)
- Anak Bajang Menggiring Angin (1983, Gramedia)
|